标准的要求不同。无公害茶和绿色食品(A级)茶生产过程中，允许使用高效低毒化学农药，也允许使用少量化肥，但产品中农药残留必须符合我国和欧盟规定的茶叶中农药最大残留限量标准。
无公害茶、绿色食品茶与有机茶的共同点都是要求生产的产品无公害、无污染，它们的区别主要有3点：
(1) 生产、加工标准的依据不同。无公害茶执行的标准是中华人民共和国农业行业标准《无公害食品茶叶》，2001年发布，代号为NY/5017—2001，2004年修订后代号为NY/5244—2004。绿色食品(茶)的标准农业部绿色食品发展中心(前身是农垦系统绿色食品办公室)于1995年提出，编号为NY/T288—95。经修改重新颁发行业标准，编号为：NY/T288—2002绿色食品一茶叶。有机茶标准是中华人民共和国农业部于2002年颁布的有机茶行业标准，标准代号为NY5196—2002。
(2) 标准的要求不同。无公害茶和绿色食品(A级)茶生产过程中，允许使用高效低毒化学农药，也允许使用少量化肥，但产品中农药残留必须符合我国和欧盟规定的茶叶中农药最大残留限量标准。有机茶和AA级绿色食品茶生产过程中则禁止使用人工合成的化学农药、肥料和除草剂等，只能使用有机肥料，并采用生物措施和物理的方法防治病虫草害。
(3) 颁证组织和时效不同。无公害茶由各省、自治区和计划单列市人民政府农业行政主管部门对无公害农产品基地认定，农业部农产品质量安全中心认证，证书有效期为3年。绿色食品(茶)的认证由中国绿色食品发展中心执行，证书有效期为3年。有机茶的认证是国家认证认可监督管理委员会批准的有机认证机构执行认证。中国有机茶认证机构主要有杭州中农质量认证中心，中国农业科学院茶叶研究所有机茶研究与发展中心(OTRDC)，南京国环有机食品发展中心(OFDC)，颁证有效期为1年。
就我国目前的茶叶生产情况看，虽然一些地区的化肥和农药用量大，造成了一些地方的污染，但仍有不少地区，特别是高山茶区，限于经济或交通等条件限制，远离工业污染，生态环境优越，很少或完全不使用化肥和农药，基本符合有机茶生产环境要求，具有发展有机茶的良好基础条件。
